磷肥对促进作物根系生长、提升抗逆性、提高产量和品质等都具有重要作用，但施入土壤的磷肥利用率普遍偏低，目前，我国小麦、玉米等主粮栽培栽培中，磷肥的当季利用率仅约20%，而在蔬菜和果树栽培上，这一数值尚不足10%（据中国农业大学冯固等人的研究）。
残存在土壤中未被吸收的磷肥会造成土壤次生盐渍化加剧，并对增产增收带来不利影响。在熟悉磷肥特点的前提下，科学施肥是节本增效并推动土地可持续开发利用的重要保障。生产上，提高磷肥利用率要做好三点。
一、土壤磷含量适宜 施入土壤的磷肥在被作物吸收前需要转化为可溶性的有效态磷，这一过程一般通过两种途径来实现，其一是土壤中具有解磷功能的微生物，这类微生物在新陈代谢过程中产生的酶及酸性物质，可将磷元素转变为更易被根系吸收的有效态磷；其二是植物根尖释放出的氢离子，会使磷元素转变为可溶性的磷酸根，同时根系释放出的磷酸酶也会促进磷元素向有效态转化。
解磷微生物与根系同时发挥作用，但是两者协同解磷的效率与土壤中的磷含量高低有密切关系，含量过高或过低，都会影响磷向有效态转化的效率。据冯固教授的研究，土壤磷浓度为20mg/kg时，解磷微生物和根系共同作用可将磷肥的释放效率稳定在较高水平。
二、因地施肥 充分了解生产用地的酸碱性，是科学选购并使用肥料，继而提高肥料效用的重要依据。整体来看，我国土壤酸碱度的变化规律是从西北到东南酸性逐渐递增，酸碱性不同的土壤，在选用磷肥时要有所区分。
对碱性土壤，应选用偏酸性的磷肥，这类肥料包括磷酸一铵、过磷酸钙等；对酸性土壤应选用碱性肥料，这类肥料包括钙镁磷肥、磷酸二铵等。通过施用与土壤酸碱性相反的磷肥，不但可以提高肥料的有效利用率，减缓次生盐渍化的发生，而且可以改良土壤，使其维持在更适宜于大多数作物生长的中性范围内。
三、增施菌肥 在磷肥的施用理念上，普遍存在注重用量而忽视吸收效率的误区，在目前磷元素普标超标背景，磷肥施用的理念应转变为“减量增效”。
如前文所述，解磷微生物是决定磷肥肥效释放的重要因素，这类微生物的活性高低、群落大小会直接影响土壤中磷肥的有效态占比及吸收效率。
因此，在生产上应在减少磷肥用量的同时，通过增施富含芽孢杆菌、假单胞杆菌、欧文氏菌等具有解磷功能的菌肥，来加快土壤中无效态磷向有效态磷的转化。解磷菌肥种类丰富，需要提醒的是，在选购时要注意生产日期和保质期，同时要通过增施有机肥来为这些微生物的繁殖并保持较高活性创造适宜环境。
