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商品有机肥与粪肥真的不一样商品有机肥和粪肥同样能够补充有机质，促进团粒结构的形成。但从绿色健康可持续发展方面来讲，商品有机肥更有优势。这是因为商品有机肥与粪肥有很多不同之处。
首先，商品有机肥比粪肥“无害”。两种肥料的区别重点在于“腐熟”和“无害”。与商品有机肥相比，粪肥存在许多缺陷：
粪肥
一是含盐分较多，容易使土壤盐化。
二是粪肥带有大量的病菌、虫卵，最易引发棚室内的病虫害。
三是粪肥养分含量不稳定，不能做到合理补肥。
四是粪肥内若含有害物质、重金属物质时，仅凭借高温发酵不能去除。
畜禽粪便对土壤既有有利的一面，也有不利的一面，两个方面在一定条件下能够相互转化。
有利方面在于：能够作为肥料施用于农田培肥土壤，经常施用粪肥也能提高土壤抗风化和水侵蚀的能力，改变土壤的通气和耕作条件，增加土壤有机质和有益微生物的生长。
不利的方面在于：过度使用未经无害化处理的粪便会危害农作物、土壤、地表水和地下水水质。在某些情况下(通常是新鲜粪便)有烧苗现象；大量使用粪便也能引起土壤中溶解盐的积累，使土壤盐分增高，植物生长受影响。据报道，1999年在非洲有31%的牧场因畜禽粪便污染导致土壤发生盐渍化，土壤肥力下降。
商品有机肥改良土壤效果更迅速，若是土壤出现了不良状况，使用商品有机肥改良比粪肥更加快速。
这是因为商品有机肥具有洁净性和完熟性两大特点。商品有机肥在制作过程中不仅进行高温杀菌杀虫，通过微生物完全发酵，并且很好地控制氧气和发酵温度，使有机物质充分分解成为直接形成团粒结构的腐殖质等，同时产生的氨基酸和有益代谢产物得以保留。使用后不会产生对蔬菜有影响的物质。
商品有机肥的养分配比更合理商品有机肥中的各类养分是可调整的，可以针对不同的土壤状况使用不同养分含量的产品。
棚室土壤改良选择什么样的商品有机肥？商品有机肥的品种很多，而用于制作商品有机肥的原料更多，因此在改良土壤的时候也应选择合适的商品有机肥。例如含20亿活性菌的微生物菌剂，更能增强土壤通透性，改良土壤。那么哪些原料可用于制造商品有机肥呢？
一是自然界有机物，如森林枯枝落叶。
二是农业作物或废弃物，如绿肥、作物秸秆、豆粕、棉粕、食用菌菌渣。
三是畜禽粪便，如鸡鸭粪、猪粪、牛羊马粪、兔粪等。
四是工业废弃物，如酒糟、醋糟、木薯渣、糖渣、味精发酵氨基酸尾液。经过无害化处理以后，这些原料生产的商品有机肥都可以用于棚室蔬菜生产。
而商品有机肥根据功能不同又分为很多种类，在补充有机质的基础上添加大中微量元素、甲壳素、生物菌等等不同的功能物质，使得商品有机肥的效果又大大提升。
在这里分析两类：
一是含有甲壳素的有机肥。甲壳素的功能很多，很多种植户也学会了使用甲壳素来生根养根，同时对于有根结线虫的土壤，可使用甲壳素与阿维菌素配合防治。
二是含有生物菌的有机肥。
生物菌与有机肥配合使用，能更快更好地改良土壤，主要有两大特点：
一是富含有益微生物菌群，环境适应性强，易发挥出种群优势。
二是富含生理活性物质，如吲哚乙酸、赤霉素、多种维生素以及氨基酸、核酸、生长素等。
商品有机肥不同于粪肥使用方法应有变。
虽然说商品有机肥与粪肥同样能够改良土壤，但使用方法是不一样的。记者在采访时了解到，有些种植户使用商品有机肥后感觉不如粪肥有效果，这是因为使用的方法没有改变造成的。在这里提醒大家，使用商品有机肥时要做好以下三点：
一、底施要足量。
有些种植户觉商品有机肥价格较贵，不如粪肥用量大。但在改良土壤时需要补充足够的有机质才能起到一定的效果。因商品有机肥已经过无害化处理，不会像粪肥那样产生烧根熏苗的情况。因此，使用商品有机肥时要使用足够的数量。
二、穴施沟施要正确。
很多菜农的有机肥使用方式是穴施或沟施，需要注意的是要与植株根系保持一定的距离。比如在两行蔬菜的中间沟施，也可在两棵植株间穴施。
三、讲究与其他肥料配合。
商品有机肥的主要作用是改良土壤，维护土壤生态。里面含有的大中微量元素毕竟有限。在高收入经济作物使用时一定要与其他类型的肥料配合使用。如与冲施肥、进口水溶肥等。
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