近年来，关于贝莱斯芽孢杆菌的研究主要集中在饲料、医药、纺织、水产、污水处理、植物保护等领域。作为一种新型生防微生物因子，贝莱斯芽孢杆菌在植物病害防控、促进植物生长等方面备受关注。
防治植物病害
贝莱斯芽孢杆菌能有效抑制多种植物病原菌，如辣椒疫霉、腐皮镰刀菌、尖孢镰刀菌、立枯丝核菌。以及叶类蔬菜上几种病原真菌包括褐斑病菌、茎点霉、灰葡萄孢石竹变种和油菜菌核病菌，有效防控多种植物病害。
贝莱斯芽孢杆菌对病原微生物的拮抗作用主要通过其分泌的抑菌活性代谢物来起作用。该菌可以分泌产生多种生物活性物质，包括细胞壁降解酶类（葡聚糖酶和蛋白酶）、脂肽类抗生素（表面活性素、伊枯草菌素和芬荠素）以及聚酮类抗生素。
作用机制：水解病源真菌细胞壁；抑制病原真菌分生孢子萌发、芽管生长和附着胞的形成；改变细胞质膜的结构和渗透性，引起胞内物质外泄，导致细胞死亡。
促进作物生长
贝莱斯芽孢杆菌能分泌多种植物激素和挥发性化合物，如IAA、NH、和ACC脱氨酶，促进甜菜、胡萝卜、黄瓜、胡椒、土豆、小萝卜、南瓜、番茄和芜菁多种种作物的生长。
