中药材常见的根部病害，常常是由于重茬引起的土传病害，常见的有根腐病、立枯病、白绢病、根结线虫、猝倒病等多种病害，因为茎块类中药材普遍存在种苗带菌问题，因此农户要注意药物处理种苗。
其次茎块类中药材的茎块生长在地下，土壤团粒结构会影响中药材的健康生长，如果土壤湿度大易造成土壤空间闭塞，易滋生各种根部病害，土壤团粒结构过硬或过密也会影响茎块膨大生长，气体流动不畅易引发病害。
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在种植中药材的时候，防治土传病害，农户可以选择土质疏松并富含有机质的半沙性土壤种植，起垄种植或深翻种植可以促进中药材的根茎生长，在灌溉的时候还应选择水温和土温相近的时机灌溉。
一旦发现中药材田中有土传病害，农户要及时防治，才能减轻土传病害的危害，可以灌根或冲施微生物菌肥根小子，杀灭土壤中的有害菌，补充土壤中的有机质含量，促进中药材根系生长，提高中药材的自身抗性，让中药材有个好的产量和品质。