目前涉及的微生物肥料产品，主要分为三大种：生物有机肥、微生物菌剂、复合微生物肥料，那下面我们就来了解下这三种微生物肥料的区别生物有机肥：指特定功能微生物与主要以动植物残体（畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。要求使用微生物菌种应安全、有效，有明确来源和种名，菌株安全性应符合NY 1109的规定，粉状松散无恶臭味，粒状均匀，无腐败味，无机械杂质。行业执行标准：NY884-2012葡彩®生物有机肥
微生物菌剂：指目标微生物（有效菌）经过工业化生产扩繁后加工制成的活菌制剂。它具有直接或间接改良土壤、恢复地力，维持根际微生物区系平衡，降解有毒、有害物质的作用；应用于农业生产，通过其中所含微生物的生命活动，增加植物养分吸受的供应量或促进植物生长、改善农产品品质及农业生态环境。国家执行标准：GB20287-2006葡彩®菌萄
复合微生物肥料：指特定微生物与大量元素营养物质和有机质三元复合而成，能提供、保持或改善植物营养，提高农产品产量或改善农产品品质的活体微生物制品。复合微生物是当下最实用的三元生物肥料。行业标准：复合微生物肥料NY/T798-2015
有机质含量：生物有机肥有机质要求（≥40%）和固体复合微生物肥料（≧20%）对有机质的含量做了明确的规定，微生物菌剂和液体复合微生物肥料对有机质含量没有明确规定。水分含量：生物有机肥和固体复合微生物肥料的水分含量（≦30%）、粉剂微生物菌剂水分含量（≦35%）、颗粒微生物菌剂水分含量（≦20%）都规定了明确的水分含量，液体的微生物菌剂和复合微生物肥料没有明确规定。有效活菌数：生物有机肥（≧0.2亿个/克）、粉剂和液体微生物菌剂（≧2.0亿个/克）、颗粒微生物菌剂（≧1.0亿个/克）、液体复合微生物肥料（≧0.5亿个/克）、固体复合微生物肥料（≧0.2亿个/克）都规定了明确的有效活菌数有效期：微生物肥料都规定了明确的有效期，主要原因是产品中添加的功能微生物具有特定的有效时间，如果微生物失活，将不具备或降低相应产品具有的功能和效果。土壤肥力有生物肥力、化学肥力和物理肥力三部分组成，使用微生物肥料后能提供土壤的生物肥力，可以间接促进化学肥力和物理肥力的提高，所以使用微生物肥料不能完全代替化肥，但可以提高肥料利用率，减少化肥的投入。在提高相同土壤肥力的情况下，生物有机肥的亩投入比微生物菌剂的高，复合微生物肥料的亩投入比生物有机肥的高。 如何选择微生物肥料：1、选择合适的菌种：微生物肥料不能盲目施用，必须根据作物种类、土壤条件、栽培管理措施及生产需要选择相应的微生物肥料产品，正确施用微生物肥料可以减少化肥和农药的施用量。
如：豆科作物选择根瘤菌剂、枯草芽孢杆菌可以达到固氮的目的；
草莓作物选择巨大芽孢杆菌可以达到解磷的目的，提高磷肥的利用率，降低磷肥用量；
葡萄作物选择枯草芽孢杆菌和胶冻样芽孢杆菌（
葡彩®菌萄）可以达到固氮解钾的目的，提高肥料的利用率。
生物菌肥的分类
两种以上多种复合菌相互促进、相互补充，抗土传病害效果远远大于单一菌种。有益菌相互协同，共同作用，能使作物达到高产丰产的效果。
2、选择正规的包装：包装袋上应包括肥料名称、商标、规格等级、净含量、养分含量、生产商地址、电话和批号、肥料登记证号、执行标准。微生物肥料的肥料等级证应该为农业部颁发，标识为：微生物肥（年代号）临（或准）字XXXX号；执行标准为：生物有机肥（NY884-2012）、复合微生物肥料（NY/T798-2015）、农用微生物菌剂（GB20287-2006）。
当前微生物肥料市场存在的主要问题：
a、部分无肥料登记证企业假冒已获证企业登记证号生产；
b、随意将肥料登记证号转让给不具备微生物肥料生产能力的企业加工生产；
c、使用省级农业部门颁发的登记证号；
d、随意更改包装标识、误导消费者：如复合微生物肥料，氮磷钾总养分过少起不到应有的效果，过多则影响生物菌的存活，但有些包装上将氮磷钾总养分标识为40%以上，这种产品明显为假劣复合微生物肥料产品。
3、留意微生物肥料的有效活菌数和有效期：对于微生物肥料来说，有效活菌数是一种菌肥是否达标的重要依据，国家规定生物有机肥和固体复合微生物肥料有效活菌数≧0.2亿个/克，液体复合微生物肥料有效活菌数≧0.5亿个/克，粉剂和液体微生物菌剂有效活菌数≧2.0亿个/克（颗粒≧1.0亿个/克）。如果达不到这一标准，说明产品质量达不到要求。
其次产品本身的有效性，施用菌肥是一定要检查是否过了保质期，购买后要尽早施用。
